Cerros: Las principales serranías se encuentran al noroeste del municipio, se localizan las mesas de El Ocote y Esquivel, el Cerro Alto con altura de 1,900 metros; al oriente, el Cerro Carrillo, con 2,300 metros, los cerros Puerto Pedregoso y La Mina: al centro y sur del municipio, están los cerros: Temastian, La Calaverna, el Petacal y Mesa de González.

El poblado está atravesado de norte a sur por el arroyo de La Cañada. Este hace una "Y" griega en el extremo norte con el arroyo de Santa María. Existe entre el Municipio de Colotlán y Totatiche, un río denominado "Cartagenas".

Cuenta con cinco presas el Municipio:

• Presa de la Candelaria
• Magallanes
• Temastian
• La Boquilla
• Agua Zarca

Los arroyos más importantes que son de caudal permanente son:

• Hondo
• El Macho
• Temastian

Los demás como:

• El arroyo Calabazas
• Balcones
• Feliz
• Verde Saldaña
• Charco Hondo
• El Puerto
• El Loro
• Agua Zarca
• Las Moras
• Las Adjuntas
• Muchos otros son de temporal.